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PROTAC终于获批:下一个难题,是把复杂分子做成稳定药品
发布日期:2026 . 07 . 04
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引言

202651日,全球首款PROTAC药物 VepdegestrantVeppanu™)获FDA批准上市,这一曾经被视为“概念性技术”的靶向蛋白降解疗法,正式跨过了从实验室到产业化的分水岭。截至目前,全球已有超过30PROTAC分子进入临床研究阶段,靶点覆盖ERARBTKEGFR等多个领域。

VepdegestrantFDA批准上市

 

如果说PROTAC领域之前的核心命题是 “能不能降解靶点、能不能突破不可成药空间”,那么随着首款产品落地与临床管线的密集推进,行业竞争的重心正在悄然转向——“能不能把复杂的双功能分子,做成质量可控、批次稳定、可持续供应的药品”

 

PROTAC全链路CMC开发中,固态研究覆盖从分子筛选到量产放大的完整周期,是把控研发节奏、决定商业化成败的关键。

 

 

#1 从分子结构看:PROTAC的固态开发存在哪些难点?

PROTAC分子最典型的特征,是“靶蛋白配体-Linker-E3连接酶配体”的三段式双功能结构。这种独特的分子架构赋予了它独特的药理学优势,但从固态化学的基本规律出发,这类结构特性也往往会带来三类典型的固态开发挑战。

 

①高构象柔性:结晶驱动力普遍偏弱

PROTAC分子量通常在700–1200Da之间,远高于传统小分子药物(一般<500Da)。更重要的是,Linker通常由可旋转的单键构成,使得整个分子具有极高的构象自由度。

从结晶原理来看,分子可稳定存在的构象越多,排列形成有序晶格的阻力通常就越大。所以多数 PROTAC 的结晶驱动力先天不足:不仅获得高质量结晶的难度大概率高于传统小分子,体系中也更容易出现多种亚稳态晶型,整体无定形的倾向更强。

 

②两亲性与多氢键位点:固态稳定性与引湿性风险更突出

图为AI生成示意图

 

PROTAC分子两端分别模拟蛋白蛋白相互作用界面,通常含有丰富的极性官能团、酰胺键、芳杂环等,能形成氢键的位点很多;同时为了保证透膜性,分子设计里又必须加入疏水片段,天然就带有两亲性。

这种结构属性下,PROTAC的固体形态更容易和环境里的水、溶剂分子发生相互作用,相应带来几个实际问题:一是引湿性普遍偏高,对生产和储存的湿度条件更敏感;二是结晶过程中容易形成水合物或溶剂合物,不同相态之间的转化边界不好把控;三是固态下的化学降解路径更复杂,长期稳定性的管控难度更大。

 

Linker结构差异:晶型波动与杂质干扰的双重不确定性

Linker不仅是连接两个配体的绳索, 它的长短、刚性、取代位点都会影响整个分子的构象、理化性质,甚至降解活性。

药化优化的过程里,Linker哪怕只是微调长度、刚性或者极性基团的位置,都可能改变分子的堆积方式,甚至让整套晶型谱发生变化,导致前期做的固态研究成果可能没法直接沿用。

另外,合成中产生的 Linker 相关杂质、残留的配体片段,结构和主成分非常接近,可能会干扰结晶成核的过程,甚至嵌入晶格,影响晶型和粒度分布,进而增加结晶工艺的控制难度。

 

 

 

#2 PROTAC固态研究的三大应对路径

PROTAC作用模式与连接链设计示意图(引自 Unraveling the Role of Linker Design in Proteolysis Targeting Chimeras, 2021

 

面对PROTAC这类结构复杂的分子,固态研究不只是筛一个晶型,更重要的是提前判断:这个分子能不能稳定结晶?遇到水分、溶剂或温度变化会不会变?放大生产时能不能稳定做出来?

因此,PROTAC的固态开发需要尽早介入,把后期可能出现的问题提前识别清楚。

 

①     应对高构象柔性:关注无定形状态下的固态转化风险

PROTAC分子构象柔性高,合成或干燥后更容易以无定形粉末的形式存在。需要明确的是,无定形并不等于不能成药,也不意味着后续开发一定要转向结晶态;如果它的溶出表现、稳定性和工艺可控性能够满足要求,无定形本身也可以成为一种可考虑的开发形态。

但无定形状态也不能简单视为“没有晶型问题”。由于无定形通常处在相对高能状态,在储存、干燥、粉碎、制剂加工或接触水分和残留溶剂的过程中,仍然可能发生转晶,或者形成水合物、溶剂合物等新的固态形态。这些变化一旦发生,可能会进一步影响溶出、粒度、引湿性和长期稳定性。

因此,对于容易形成无定形的PROTAC分子,固态研究的重点不应只是能不能筛出晶体,还要尽早判断无定形状态本身是否稳定、在不同温湿度和工艺条件下会不会转化,以及潜在转化后的形态是否会影响后续开发。这样做的目的,是把无定形作为一种可评估的固态路径,同时提前识别它可能带来的转晶和稳定性风险,避免到制剂或放大阶段再被动调整。

 

②     应对两亲性与多氢键位点:提前排查水分和稳定性风险

PROTAC分子极性位点多,又带有疏水结构片段,其固体形态很容易受到水分和溶剂影响。比如,同一个样品在不同湿度下,可能只是吸水,也可能形成水合物,甚至出现不可逆的晶型转变。

这些问题如果不在早期排查清楚,后续可能会影响储存条件、包装选择、制剂开发和长期稳定性。因此,在确定候选固态形态时,不能只看它“能不能制备出来”,还要验证它在不同湿度、温度和不同介质环境下能不能保持稳定。

最终优选的固态形态,也不一定是某一项指标最突出的,而是结晶稳定性、引湿性、化学稳定性和溶出表现之间相对平衡的形态。

 

③     应对Linker结构差异:把杂质和放大问题提前考虑进去

LinkerPROTAC药化优化中调整最频繁的结构单元,其长度、刚性或极性稍有变化,都可能影响分子的晶格堆积方式,导致晶型谱发生变化。所以在药化优化过程中,固态研究最好同步跟进,而不是等结构完全定下来之后再重新开始。

另外,合成过程中产生的Linker相关杂质、残留配体片段往往和主成分结构相近,它们对结晶的影响远不止含量超标这么简单。有些杂质可能会影响结晶成核过程、改变晶习和粒度分布,甚至干扰目标晶型的形成。

因此,到了工艺开发阶段,需要同时考虑两个问题:一是有效去除关键杂质,二是稳定制备出目标晶型并控制粒度。只有这两点同时解决,后续放大生产和批次一致性才更有保障。

 

 

最后

首款PROTAC获批是行业的重要里程碑,但PROTAC的产业化比拼,其实才刚拉开序幕。

从“能降解靶点” 到能做成药,从实验室里的小试样品到稳定供应的商业化产品,固态研究正是连接分子设计与药品质量的核心纽带——它决定了分子最终以什么形态做成制剂、用什么工艺实现放大、靠什么稳定性保障货架期。

对于PROTAC这类结构特殊、开发逻辑和传统小分子差异很大的新型分子,没有通用的开发模板,也没有捷径可走。只有顺着分子本身的结构特点,搭建一套针对性的固态研究体系,才能在后续的产业化竞争里,把复杂的双功能分子,真正做成质量可控、稳定可及的药品。

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