在药物研发的过程中，用药物来筛选作用靶点是一个非常重要的环节，能否发现并验证到正确的药物靶点直接关系到后续药物研发的成败。青云瑞晶推出基于化学蛋白质组学的两种最新药物靶点筛选方案——有限蛋白水解质谱技术（LiP-MS）与热蛋白质组学分析（TPP），可以从全蛋白质组层面，高效精准筛选出药物分子可能作用的蛋白靶点。我们提供基于该技术的全套解决方案，包含从样本处理、数据检测到生信分析全流程，加速药物研发进程。

有限蛋白水解质谱技术（Limited Proteolysis Mass Spectrometry）是一种通过研究小分子化合物（天然产物、代谢物等）与蛋白质相互作用，进行药物靶点筛选的技术。

通过小分子药物以单一浓度或多个浓度与细胞裂解物共同孵育，随后短暂暴露于非特异性蛋白酶进行有限酶切。由于小分子药物与蛋白质的结合可能引起蛋白质构象的变化，这种构象变化会影响蛋白酶的切割位点可及性，从而在有限的蛋白酶解过程中产生靶蛋白的特异性片段。接下来，使用胰蛋白酶对这些蛋白质片段进行进一步消化，生成适合定量质谱分析的肽段。通过比较药物处理样品与未处理样品中肽段的丰度差异，可精确识别出与小分子药物结合的蛋白质及其作用位点。

热蛋白质组学分析 （Thermal Proteome Profiling）是一种通过检测蛋白质热稳定性，确认与小分子结合的靶蛋白的药物靶点筛选技术。

药物与靶蛋白结合后，由于蛋白的构象、疏水性会产生变化或形成化学交联，引起靶蛋白热稳定性变化。在实验中，通过在梯度温度下处理蛋白质样品，检测蛋白质的热变性曲线，可以发现药物处理后靶蛋白的热稳定性变化，并利用质谱技术对全蛋白质组进行定量分析，从而实现药物靶点的筛选。

SPIDER 技术（Specific Pupylation as IDEntity Reporter）是一种基于邻近标记（Proximity Labeling）原理的新型药物靶点鉴定技术。这是一种高效且广泛适用的鉴定生物分子-蛋白质相互作用的方法，尤其适用于特定修饰的生物分子和小分子。通过特异性的酶促反应，在药物与靶标结合的瞬间进行“共价标记”，将微弱、瞬时的生物分子相互作用转化为永久的化学标签，从而实现对药物靶点的高灵敏度捕捉与精准识别。SPIDER技术可表征多种生物分子-蛋白质相互作用（涵盖 蛋白-小分子互作、蛋白-蛋白互作、蛋白-核酸互作 以及细胞表面的配体-受体相互作用），简便、可行，具有广泛的应用前景。