水合物是药物多晶型筛选中常见的"意外来客":它既可能在筛选过程中自发形成,成为潜在的晶型转变隐患;也可能凭借特定条件下更优的物理稳定性及更高的溶出速率,成为更具开发价值的优势晶型。
而评估一种水合物的开发价值的前提,是准确解析其晶体结构。
药物水合物晶体堆积与湿度诱导晶型转变示意图:晶格通道内水分子通过氢键网络稳定晶体结构;环境湿度变化可触发水合物自发生成或脱水转晶(引自 Navigating the Waters of Unconventional Crystalline Hydrates, 2015)。
#1 结构信息:水合物开发决策的核心依据
药物是否会形成水合物几乎无法通过其分子结构提前预判,绝大多数情况是在多晶型筛选过程中被动发现的。通常情况下,研发人员会通过PXRD图谱、水分检测初步识别新出现的水合物,但要判断其是否具有开发价值,必须通过拿到水合物的真实三维结构,明确两大核心信息:
n 水分子的存在数量与形式:明确晶格中水分子的精确数量、占位与结合方式,确证本品是化学计量水合物还是通道型水合物,为含量计算与质量标准制定提供分子层面的直接证据;
n 临界失水/吸水条件:基于结构推演出水合物的失水/吸水行为,明确不同温度、湿度下水分含量的变化拐点,划定工艺操作与储存的安全边界。
#2 弱结合水合物:传统单晶XRD的难点问题
单晶XRD是解析水合物晶体结构的行业通用方法,但测试过程包含单晶挑取、转移、装样、抽真空等多步操作,每一步都可能导致失水情况发生,会在瞬间破坏晶体的原位形态。即便强行收集到衍射数据,也往往会混杂混合相或无定形背景,无法还原真实的原位结构,令不少项目陷入 “发现了水合物,却测不准结构”的僵局。
这种情况通常在一些弱结合水型水合物结构解析时尤为突出。其根本原因在于,水合物的稳定性本质由结晶水在晶格中的结合方式与结合能决定,也直接对应着结构解析的难度差异:
强结合水合物以氢键或配位键牢固结合,化学计量明确、性质稳定;而弱结合水合物多为通道/孔道结构,水分子填充于晶格空隙,结合力弱,轻微的环境扰动即可能导致失水转晶乃至晶格坍塌。
药物晶体中两类水合物晶格结构对比
#3 MicroED:不稳定水合物结构解析的高效路径
MicroED(微晶电子衍射)是基于冷冻透射电镜获得的电子衍射数据,测定晶体三维空间结构的技术。其入射光束为高能电子,与晶体相互作用极强,因此即使测试晶体尺寸仅为百纳米级别(>0.1 µm),也可获得高分辨率的衍射信息,显著降低了对样品尺寸和纯度的要求。
面对水合物易失水这个难题,MicroED的独特价值尤为明显:
使用粉末样品,跳过单晶培养:可直接从API粉末中筛选微晶进行测试,既跳过了漫长的单晶培养周期,也省去了单晶挑取、转移等多步空气暴露环节,从样品处理源头降低失水转晶风险;
原位锁定水合状态:配合冷冻制样流程与低温样品台,样品无需长时间暴露于高真空环境,水合物的真实状态在毫秒间被原位锁定,彻底规避因挑样、抽真空等操作引发的失水转晶风险;
解析周期短:从收到粉末样品到完成完整的晶体结构解析,全流程可在1-3天内完成,大幅缩短结构确证周期,避免项目在结构确证环节长期停滞。
MicroED在水合物结构解析中的技术优势
#4 案例:MicroED解析牛磺熊去氧胆酸水合物原位结构
某客户多次尝试传统单晶XRD方法解析牛磺熊去氧胆酸水合物,在样品处理和抽真空时快速失水转晶,难以获得该水合物的真实晶体结构,项目结构确证环节陷入停滞。
收到客户提供的牛磺熊去氧胆酸水合物 API粉末后,我们采用MicroED技术,无需单独处理样品,直接从API粉末中挑选出尺寸合适的微晶,配合MicroED低温原位特性,仅用2天就解析出了该水合物的结构。
牛磺熊去氧胆酸API粉末样品 电镜下晶体挑选
电子衍射数据收集 晶胞结构
#5 青云瑞晶MicroED结构解析服务
MicroED结构解析服务应用场景:粉末样品结构解析、共晶药物结构解析、制剂中API晶型原位鉴别、微量样品结构解析、混合晶型确认、绝对构型解析、水合物原位结构、有机小分子
无论您面对的是难结晶样品、微量样品,还是亟需快速确认结构的候选药物分子,MicroED均可提供高效、可靠的解决方案。欢迎联系我们获取更多应用案例与服务详情。












